Có phải bồi thường vì những vi phạm khi còn làm việc không?

Chào luật sư, Vấn đề của em như sau:  Khoảng 3 năm trước em làm ở công ty TNHH, công việc của em là kế toán kho. Do công việc có áp lực rất cao nhưng mức lương lại không phù hợp nên em đã xin thôi việc (đã làm đơn xin thôi việc và làm biên bản bàng giao đầy đủ có chữ ký của các bên và công ty cho thôi việc nhưng em chưa nhận quyết định thôi việc). Khoảng nửa năm sau công ty gọi điện báo là em đã xuất sai hàng (em làm phiếu xuất kho, còn hàng thì do thủ kho xuất, thủ kho xuất hàng dựa theo phiếu xuất kho của em) và làm thiệt hại một số tiền lớn, công ty nói phải bồi thường nếu em không bồi thường thì công ty sẽ thưa ra tòa. Vì thời gian đã lâu thật sự em không biết mình có làm sai không. Đặt trường hợp em làm sai thật vậy em có phải bồi thường không vì nếu là một số tiền lờn thì em không có khả năng chi trả? Nếu em không bồi thường thì em có phạm luật không? Và em đã phạm tội gì? Có bị truy cứu hình sự không? Thưa luật sư. Rất mong luật sư tư vấn cho em biết, vì kiến thức về pháp luật em rất hạn chế. Em xin cám ơn ạ.